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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性动物群炎症因子聊天、寡核苷酸呈现的成本昂扬或操作步骤步骤流程步骤麻烦。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯讲解人员在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低代价、跨鱼类、全机构兼容的全新解决方案。

论文期刊概述

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由全国有小学科高校基因基因显性基因性与发育期生理学学调查分析所和全国有基因基因显性基因性学精主办单位的国.际科研杂志论文,秉承于曝光性命小学学科和医学专业基因基因显性基因性学方向的原创文章性调查分析拜谱生物。JGG 202多年度影响到系数7.1,Scopus科研杂志论文评分质量指标CiteScore 9.9,稳居JCR 202多年度GENETICS & HEREDITY方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY方向Q1区,稳居全国有小学科高校杂志论文区分生理学学小类1区(Top杂志论文),基因基因显性基因性学和生态学化学与大分子生理学学小类双1区。

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任何是HEATag

精妙的“二一体化”装修设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶构造的深度融合球蛋白

「品牌定位器」摸块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「接器」模块图片 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段条型码完成共价衔接。

“1+1>2”的视觉效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品图标与朔源。

Fig1: HEATag多个标出设计原理展示图

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实际战斗检查

HEATag究竟有多用打?

能够在各种不同先决条件下,保持母乳喂养两栖动物癌受损细胞系单癌受损细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。论述微商团队为 HEATag 配置了多轮 “重压自测”,从受损上皮细胞系到受损上皮细胞,从室温到温度过低,从新鲜子模板到固定好子模板,全位子安全验证它的固定义和靠谱性。

新一轮试验对於喂母乳家禽神经元系:钻研拜谱生物选定了存在人、鼠、仓鼠六个外来种类的四个神经元(HEK293T、K562、MEF、CHO),在室内温度下要 HEATag 标出后混合法测序。决定性回笼的 11447 个神经元中,85.66% 都能能够 HEATag 方形码确切配比到原外来种类,子样本间交错环境污染极低,UMAP 聚类定量分析定量分析更进行證明,HEATag 方形码与外来种类特喜欢的人基因组组特色角度不符。 随后,测评生活环境进一次升級:科学研究员再试一次在 4℃下箭头最新受损体上皮血细胞膜、在在常温下箭头甲醇稳定受损体上皮血细胞膜,可能一直箭头受损体上皮血细胞膜核。没想到即使精彩:拥有生活环境下,范本标签贴与植物物种产品信息均存在特别好的对应性,切分精确性率超 95%。就算是甲醇稳定会形成偶尔的转录本相交危害,受损体上皮血细胞膜核光催化原理有一定量 RNA 短缺,受损体上皮血细胞膜内型的引用没想到即使与最新范本始终维持保持一致,关系证明 HEATag 还可以箭头与众不同整理生活环境下的检测范本。

Fig2: HEATag 可在各个因素下做好单上皮细胞转录组混样探讨

可标注辅乳期家禽和海底无脊梁骨家禽的原代癌细胞

比如说人体生殖细胞系自测是 “地基题”,那聚集子样品正是 “扩展题”, 这种子样品之所以因人体生殖细胞类别比较复杂、学习环境应用性特俗,已成为标上科技的 “瓶颈问题”,而 HEATag 刚好在这种 “瓶颈问题” 上出现了优势与劣势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团体,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不单单能被准确无误辨认,大多数主要是细胞膜分类的聚类算法毕竟都清晰可见可辨。

更令人惊喜的是HEATag对大海生物体的配适性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与外来物种转录组有着较高不同性,找不到经常出现因高盐室内环境诱发的 “标记符号没用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可建立乳期两栖动物组识子样本多沉 scRNA-seq 介绍

Fig4: HEATag可做到新鲜感海底无脊椎骨動物多方面 scRNA-seq 阐述

HEATag与内部的根据不因起转录组的正相关变

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在达成标上的任务的同时,不太会对之后的的转录类物质析诱发干涉,确保了探讨的数据的真实的性。

Fig5: HEATag没影晌样表的 RNA 传达方法

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素可期

HEATag 能为单内部探索带来了啥?

HEATag 的價值,远只有于 “改善图标困难”,它的机灵性和共通性,正处于为单癌细胞钻研使用大量慨率

从运用场面去看

HEATag 能遮盖从 “简简单单更数据分析”(如癌组识结构与正常情况下组识结构、肿瘤药物处置与比对)到 “大数量科学研究方案”(如组识结构肿瘤肿瘤细胞图谱生成、高通芯片量选择)的全领域各种需求。发生变化 PIP-seq、Stereo-cell 等轻型可提高自己技术性的提高自己,HEATag 还能进步骤提高自己单肿瘤肿瘤细胞科学研究方案的通量,肋力科技工程团队实施大些数量的工程。

从跨研究方向前景来了解

HEATag 一方面适宜于转录组学,还能与表观dna组学、血清质组学、环境空间组学等技木紧密联系,就能够通过定制网站引索和寡核苷酸编码序列,HEATag 就能够不累结合有差异的组学步骤,不反应电磁波驯服深度.。另外,由于HEATag还就能够发展壮大单生殖细胞糖组学钻研技木。

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进行合作日常动态

拜谱怪物与陈凯硕士生导师取得阶段企业合作意愿书

必玩重视的是,在 HEATag 方法塑造出极大的用潜能的题材下,拜谱微生物技术技术已与南方地区海上科学课与建设工程江西工作的室(广东)陈凯教学完成率最初操作想法。两方工作的方案需紧紧围绕 HEATag 方法的服务业化着地、科学理论研究项目转换等朝向而铺展开的纵深操作,着力推进这个低投资成本、跨植物物种的单血神经上皮细胞标记图片方法速度快用于具体科学理论研究项目场面,为更好地工作的室可以提供更高效、经济实惠的单血神经上皮细胞理论研究机器,助推器科学理论研究项目工作的者在血神经上皮细胞微生物技术技术学、海上微生物技术技术学、常见疾病制度等各个领域赢得更好地超过
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